纤维及织物用抗菌剂有数百种之多，但常用的仅数十种，其中有机类的占90%，包括天然的与合成的2大类。天然有机抗菌剂主要从动植物中提炼精制而成，耐候性优良、毒性低、使用安全，但耐热性较差、药效持续时间短；天然有机抗菌剂主要包括甲壳素及壳聚糖、植物类提取物、微生物发酵产物和昆虫抗菌性蛋白质等。合成的有机抗菌剂品种多、应用历史也长，以有机酸、酚、醇为主要成分，具有速效、杀菌力强、来源丰富等优点，缺点是会产生微生物耐药性、耐热性较差等。
1、季铵盐类
季铵盐抗菌剂系脂肪族类季铵盐或聚烷氧基三烷基氯化铵，通常铵盐类的阳离子化合物具有杀菌能力，尤其含l2～l8个碳原子的季铵盐类，常用作纤维的消毒剂和杀菌剂。季铵盐化合物是最常用的抗菌剂，但由于其与纤维的结合力差，常与反应性树脂并用，以提高其耐久性[3]。
2、有机硅季铵盐类
有机硅季铵盐系列抗菌卫生整理剂是一类新型的阳离子表面活性剂，其分子结构可变性强，性能优良，合成简单，很有应用前景[4]。最著名的是美国道康宁公司的DC-5700，其活性成分的学名为3-(三甲氧基硅烷基)丙基二甲基十八烷基氯化物，具有耐久性强、安全性好及广谱抗菌的特点，与DC-5700结构类似，两者也具有类似的性能。
3、胍类(PHMB)
在医药应用的双胍类消毒剂中，应该选择在水中溶解度小的而对纤维吸附能力高的抗菌剂。PHMB(聚六甲撑基双胍 )具有广谱抗菌作用，可以应用在棉、羊毛及棉／羊毛的混纺织物；而且PHMB具有良好的耐热稳定性，可以添加到熔融纺丝液中制成抗菌合成纤维[5-6]，目前此产品已经市售。在PHMB盐酸盐中引进三甲氧基甲硅丙基即可制得PHGS，棉织物用l%的PHGS处理后，能杀死100%的细菌，且耐水洗。
4、卤胺化合物
卤胺化合物抗菌剂是一种新型的抗菌剂，卤胺化合物是指含有N-X键(X可以为C1或Br)的化合物，它可以由含胺、酰胺或者酰亚胺基团的化合物经氧化剂如次卤酸盐作用后得到。氯正离子具有氧化作用，可以杀死病菌等微生物，而此氯胺化合物经次氯酸盐溶液漂洗后，其中的N-H键又可以被氧化为N-C1键，重新获得杀菌功能。
